TP2 : Etude comparative des pigments rétiniens et de leur gène

Pb : Pourquoi peut-on dire que les gènes des pigments rétiniens font partie d’une famille multigénique* ?

Objectifs de la séance :

• Ouvrir les fichiers .pdb des opsines humaines pour comparer leur structure à l'aide du logiciel Rastop. Re, I

• Ouvrir le fichier Pack_pigments_Homme.edi pour comparer les séquences nucléotidiques et protéiques à l'aide du logiciel Anagène.et compléter le tableau des pourcentages de différences. Re, I

• Croiser les informations apportés par les logiciels et les documents présentés pour répondre à la problématique et retracer l'histoire évolutive de cette famille multigénique. Rai

Production attendue : un texte explicatif et un schéma s'inspirant du document 1.

Matériel : Ordinateur + logiciel Rastop et Anagène + fichiers pdb des 3 opsines + fichier Pack_pigments_Homme.edi

Document 1 : mécanismes à l'origine d'une famille multigénique

Document 2 : Position actuelle des gènes des pigments rétiniens chez l'Homme

Lexique :

Famille multigénique* : ensemble de gènes très semblables qui dérivent d'un gène ancestral par duplication / transposition / mutation (cf doc1). Les protéines codées par ces gènes sont considérées comme homologues (car elles ont plus de 20% de ressemblances) mais leurs fonctions peuvent être différentes.